Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna7C0LLJ0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms