Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms