Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms