Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia1B2RXQ2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms