Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cyp26c1B2RXA7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cyp26c1B2RXA7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cyp26c1B2RXA7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cyp26c1B2RXA7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cyp26c1B2RXA7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cyp26c1B2RXA7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms