Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clrn2B2RVW2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Clrn2B2RVW2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clrn2B2RVW2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clrn2B2RVW2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms