Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms