Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms