Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrn3B2RS91 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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