Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms