Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms