Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd5B1AYB6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mbd5B1AYB6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd5B1AYB6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms