Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr29B1ARI9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms