Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp36B1AQJ2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms