Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3173A6NAS3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms