Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5640A3KG49 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5640A3KG49 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms