Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef25A2ASI9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms