Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms