Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lgr4A2ARI4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgr4A2ARI4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms