Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms