Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabreA2AMW3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GabreA2AMW3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GabreA2AMW3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms