Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms