Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm12A2AJ77 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm12A2AJ77 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms