Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16aA2AIX1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16aA2AIX1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms