Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm11A2AGX3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms