Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2dnl2A2AFH2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms