Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2dnl1A2AFH1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl1A2AFH1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms