Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l1A2A259 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms