Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H3

Trbv16, T cell receptor beta, variable 16 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv16A0A0B4J1H3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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