Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm35392-201ENSMUST00000209934 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm37066-201ENSMUST00000192713 2061 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gfpt2-201ENSMUST00000020629 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 AC112265.1-201ENSMUST00000213522 1501 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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