Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms