Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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Cldn22Q9D7U6 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Cldn22Q9D7U6 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Cldn22Q9D7U6 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Cldn22Q9D7U6 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Cldn22Q9D7U6 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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