Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pacsin3Q99JB8 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pacsin3Q99JB8 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms