Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx8Q8CFD4 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snx8Q8CFD4 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms