Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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