Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms