Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Chsy1Q6ZQ11 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Chsy1Q6ZQ11 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Chsy1Q6ZQ11 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Chsy1Q6ZQ11 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Chsy1Q6ZQ11 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Chsy1Q6ZQ11 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Chsy1Q6ZQ11 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
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Chsy1Q6ZQ11 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Chsy1Q6ZQ11 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Chsy1Q6ZQ11 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Chsy1Q6ZQ11 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Chsy1Q6ZQ11 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Chsy1Q6ZQ11 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Chsy1Q6ZQ11 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Chsy1Q6ZQ11 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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