Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TceancQ3US16 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms