Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Traf3ip1Q149C2 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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Traf3ip1Q149C2 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Traf3ip1Q149C2 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Traf3ip1Q149C2 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Traf3ip1Q149C2 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Traf3ip1Q149C2 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Traf3ip1Q149C2 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Traf3ip1Q149C2 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Traf3ip1Q149C2 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Traf3ip1Q149C2 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Traf3ip1Q149C2 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Traf3ip1Q149C2 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Traf3ip1Q149C2 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Traf3ip1Q149C2 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Traf3ip1Q149C2 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Traf3ip1Q149C2 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Traf3ip1Q149C2 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Traf3ip1Q149C2 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 271.1 ms