Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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