Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Hoxc11P31313 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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