Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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RxraP28700 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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