Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Thy1-204ENSMUST00000214627 446 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC122360.1-201ENSMUST00000217737 624 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Zfp474-202ENSMUST00000209270 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Musk-205ENSMUST00000102893 3323 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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