Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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PtpraP18052 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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PtpraP18052 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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PtpraP18052 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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PtpraP18052 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
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PtpraP18052 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
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PtpraP18052 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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PtpraP18052 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtpraP18052 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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