Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm42572-201ENSMUST00000202292 3378 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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