Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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