Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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H2-M1F7CXU4 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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H2-M1F7CXU4 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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H2-M1F7CXU4 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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H2-M1F7CXU4 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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H2-M1F7CXU4 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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