Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Prrt4B2RU40 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms