Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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