Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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